Na listama priznatih voda u BiH upisano 40 mineralnih, 48 izvorskih i 13 stonih
Iz Agencije ističu da su sve prirodne mineralne i prirodne izvorske vode koje se stavljaju na tržište BiH u skladu sa Uredbom o prirodnim mineralnim i prirodnim izvorskim vodama, te moraju biti priznate i imati odluku o priznavanju koju izdaje ova institucija, nakon postupka priznavanja.
Postupak priznavanja sprovodi Komisija za priznavanje prirodnih mineralnih, prirodnih izvorskih i stonih voda u BiH, koju imenuje Savjet ministara.
Uslovi za priznavanje prirodnih mineralnih i prirodnih izvorskih voda su zdravstvena ispravnost, odgovarajuća organoleptička svojstva, ispunjavanje zahtjeva geoloških, hidroloških, fizičkih, fizičko-hemijskih i hemijskih ispitivanja, mikrobioloških ispitivanja na izvoru, i farmakoloških, fizioloških i kliničkih ispitivanja.
Subjekat u poslovanju sa hranom kojem je izdato Rješenje o priznavanju prirodne mineralne ili prirodne izvorske vode dužan je da najmanje jednom godišnje, prije flaširanja, o svom trošku, izvrši provjeru usklađenosti vode koju eksploatiše sa propisanim zahtjevima u dijelu koji se odnosi na mikrobiološka i fizičko-hemijska svojstva propisana Uredbom.
Pored toga, Uredbom su propisane i zvanične kontrole koje sprovode nadležni inspekcijski organi.